L'eurhamphaea vexilligera est un cténophore difficile à repérer tant il est transparent. Comme pour de nombreux cténophores, c'est grâce aux battements des rangées de cils que l'on pourra l'observer. De forme allongée, il ne mesure pas plus 10 cm. il possède deux lobe dans son extrémité antérieure (ici à droite). Ils servent pour le déplacement de l'animal et encercle l'orifice buccale. L'extrémité postérieure est effilée et possède 2 filaments.

Le long de son corps il possède plusieurs rangées de cils locomoteurs. A leur base nous pouvons distinguer des points rouges. Selon la profondeur d'observation, la couleur de ces points varie, plus on s'enfonce, plus la couleur s'assombrit, jusqu'au bleu-noir.